役員会の組織と各部の仕事は以下の通りです。二年ごとに担当回生が変わります。

役職仕事内容
会長会をまとめ運営する。
副会長会長と一緒に会をまとめる。
会計同窓会の会計を管理し、予算を作成し、役員会の決定によって執行する。
決算を行い、報告する。　
書記書記は、同窓会の総会（年1回）・幹事会（年2回）・役員会（8月を除く毎月）の議事録を作成し会館に保管する。
総会・幹事会等の案内発送業務を行う。
厚生部主に同窓会主催のクリスマスバザーの企画、運営を担当する。
互助活動部同窓会の慶弔関係を取り扱う。11月に2年に1度の追悼ミサを企画、担当する。
社会事業部同窓会の寄付事業を担当する。福祉施設や各種団体の活動内容を検討し寄付先や配分を決める。
災害が起こった場合、総会・幹事会で被災地への寄付金「みこころのともしび基金」への呼びかけを行う。
新入会員の歓迎会を企画・実施する。
広報部会報(年1回/5月発行)の企画・編集を行う。
そのために行事の写真撮影や原稿依頼を行う。
リサイクル部・制服類のリサイクル（収集、在校生への還元／体操服などは海外姉妹校支援へ利用）。
※制服デザイン一新に伴い、旧制服の受付は終了しました。現在は新制服が集まり次第、活動を再開する準備期間です。
・「ようこそ小林の丘へ」や国際交流の運営サポート。
総務部会員の名簿管理を行う。
みこころ会事務室と連携し、みこころ会館の管理·運営（会館利用·清掃等の管理）を行う。
東京支部東京支部は、関東在住の小林みこころ会会員の親睦をはかる。
年1回の東京支部総会を開催し、三光会バザー・宮代会バザー・JASHの日のミニバザー等に出店する。
★その他、各部は同窓会主催のクリスマス・バザーでは、食品販売・子どもくじなどを分担して担当します。 またバザーでは31アイスクリームの販売、飲み物の販売、同窓会グッズの販売などの協力を行っています。
これらのバザーの収益は、学院や聖心会への寄付、各種団体への寄付に使われています。